RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA13Q96N96 652 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 A6NL46 340 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF487B1APH4 448 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ADAM12O43184 909 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TLL1O43897 1013 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF15O94989 841 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC12A1Q13621 1099 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SHHQ15465 462 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LEMD2Q8NC56 503 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 STYXQ8WUJ0 223 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ROPN1LQ96C74 230 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HDAC11Q96DB2 347 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM169Q96HH4 297 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SCYL1Q96KG9 808 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TBCBQ99426 244 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SP140LQ9H930 580 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC78A2IDD5 438 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 OR6C75A6NL08 312 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ASNA1O43681 348 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LCN8Q6JVE9 175 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPARTQ8N0X7 666 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HSFY1Q96LI6 401 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AGAP2Q99490 1192 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TLK1Q9UKI8 766 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LAMA3Q16787 3333 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CEP290O15078 2479 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ABCG1P45844 678 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLCQ05315 142 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPRED2Q7Z698 418 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SCML4Q8N228 414 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MUS81Q96NY9 551 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MARCH7Q9H992 704 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TOR1BO14657 336 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DLX3O60479 287 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NPHS1O60500 1241 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ALBP02768 609 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GPIP06744 558 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BMP4P12644 408 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MYOGP15173 224 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HTR1BP28222 390 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BNIP2Q12982 314 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC14Q49A88 953 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RAB41Q5JT25 222 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CCNYL1Q8N7R7 359 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ING2Q9H160 280 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CHD7Q9P2D1 2997 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.71■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TARM1B6A8C7 271 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 H7C4K7 107 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 AREL1O15033 823 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MDM4O15151 490 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CAPN15O75808 1086 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FGF18O76093 207 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 OXTRP30559 389 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 HADHAP40939 763 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms