RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SNX2O60749 519 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PGLSO95336 258 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 UROSP10746 265 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CLCN7P51798 805 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SLC7A2P52569 658 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 HK3P52790 923 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 C6orf10Q5SRN2 563 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SPATA19Q7Z5L4 167 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SYVN1Q86TM6 617 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CPNE9Q8IYJ1 553 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 WFDC5Q8TCV5 224 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 EID2BQ96D98 161 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 C19orf43Q9BQ61 176 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 Q9H521 79 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RAB26Q9ULW5 256 aa27.39■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CHEK2O96017 543 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PDK3Q15120 406 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 FBXO48Q5FWF7 155 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 XKR7Q5GH72 579 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RNF220Q5VTB9 566 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 FBXL19Q6PCT2 694 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PHC3Q8NDX5 983 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 OR56A4Q8NGH8 313 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PIH1D2Q8WWB5 315 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 FAM192AQ9GZU8 254 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PFDN4Q9NQP4 134 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ABCD2Q9UBJ2 740 aa27.38■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 A0A0U1RQS6 177 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8CPA6NN73 597 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ZXDBP98169 803 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GRIK2Q13002 908 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 IL23RQ5VWK5 629 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ITIH5Q86UX2 942 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 MARVELD2Q8N4S9 558 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TSPEARQ8WU66 669 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ATP6V1E2Q96A05 226 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 HGH1Q9BTY7 390 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 YIPF3Q9GZM5 350 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 IL21Q9HBE4 155 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CD274Q9NZQ7 290 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 MAP10Q9P2G4 905 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ZNF225Q9UK10 706 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 MAFFQ9ULX9 164 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TRIM17Q9Y577 477 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 AP4S1Q9Y587 144 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CPQQ9Y646 472 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ANGPT2O15123 496 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PRAMEF12O95522 483 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CAPN3P20807 821 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RETSATQ6NUM9 610 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TOX2Q96NM4 488 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 NUDT4Q9NZJ9 180 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 DHRS7Q9Y394 339 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TIMM22Q9Y584 194 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GPR45Q9Y5Y3 372 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 E2F3O00716 465 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TXNDC9O14530 226 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GIPC1O14908 333 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 HSPA13P48723 471 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 NME5P56597 212 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RPS6KA2Q15349 733 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TGFBIQ15582 683 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TXNDC8Q6A555 127 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ZNF382Q96SR6 550 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 CCT7Q99832 543 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A3Q9BRY0 314 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 AP1G1O43747 822 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 ECT2LQ008S8 904 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TLE2Q04725 743 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 TLR1Q15399 786 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 RBBP7Q16576 425 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 MAP7D1Q3KQU3 841 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 VPS26BQ4G0F5 336 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 UGT2A3Q6UWM9 527 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CERS1-201ENST00000429504 GPR39O43194 453 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms