RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DENND2CQ68D51 928 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 BMPERQ8N8U9 685 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ART4Q93070 314 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NUS1Q96E22 293 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DTD2Q96FN9 168 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TAAR9Q96RI9 348 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT1Q99943 283 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SYT11Q9BT88 431 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RAD1O60671 282 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SFTPCP11686 197 aa6.51□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 HTR7P34969 479 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 IL10RBQ08334 325 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 KCNAB2Q13303 367 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 MAMLD1Q13495 774 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SQSTM1Q13501 440 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DPYSQ14117 519 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ANKS6Q68DC2 871 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 BORAQ6PGQ7 559 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RFX8Q6ZV50 586 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZVL8 140 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM74Q86UV6 250 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RNF31Q96EP0 1072 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PSKH2Q96QS6 385 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 AGAP2Q99490 1192 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.51□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SP110Q9HB58 689 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NOD2Q9HC29 1040 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 FANCLQ9NW38 375 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RELNP78509 3460 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 COL12A1Q99715 3063 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 EFCAB7A8K855 629 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CPP00450 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 IVLP07476 585 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TCF4P15884 667 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CTPS1P17812 591 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PSMA2P25787 234 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 IL1R2P27930 398 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 MIPP30301 263 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ACTR1BP42025 376 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 GPR3P46089 330 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ARL4DP49703 201 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ACTR1AP61163 376 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 MAXP61244 160 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 AP1S1P61966 158 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.5□□□□□ -1.37
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