RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 ING2Q9H160 280 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 EHD1Q9H4M9 534 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CBX4O00257 560 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 NRP2O60462 931 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 KPNA6O60684 536 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 RHOQP17081 205 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ACAP2Q15057 778 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 KDELC1Q6UW63 502 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HM13Q8TCT9 377 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ELMO1Q92556 727 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HBEGFQ99075 208 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 RNF112Q9ULX5 631 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TNFRSF10BO14763 440 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 AXIN1O15169 862 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 BAIAP3O94812 1187 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 MYO1DO94832 1006 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINF2P08697 491 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SLC7A1P30825 629 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C17orf50Q8WW18 174 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C3orf30Q96M34 536 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 Q9Y3F1 56 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 M0QZQ0 153 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF623O75123 536 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 S1PR4O95977 384 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CYP51A1Q16850 503 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C17orf99Q6UX52 265 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PTERQ96BW5 349 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 C19orf60Q96EN9 201 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CSF3RQ99062 836 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HCSTQ9UBK5 93 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TLR5O60602 858 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HGFP14210 728 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CTGFP29279 349 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TUBA4AP68366 448 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF33AQ06730 810 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SQLEQ14534 574 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SPCS2Q15005 226 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ISCA2Q86U28 154 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 FAR2Q96K12 515 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 AASSQ9UDR5 926 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 DHRS12A0PJE2 317 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 IGLV3-25P01717 112 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CYP11A1P05108 521 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 GATMP50440 423 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 PRKCZQ05513 592 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SLC13A2Q13183 592 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 IHHQ14623 411 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 RBBP7Q16576 425 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 MOGQ16653 247 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 IFNL1Q8IU54 200 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SNX19Q92543 992 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 MUS81Q96NY9 551 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 GIN1Q9NXP7 522 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms