RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404141.5

PAXIP1-202, Transcript of PAX interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PAXIP1, Length 3,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1-202ENST00000404141 SARDHQ9UL12 918 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 J3KR12 359 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 DIRAS1O95057 198 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 FCGR1AP12314 374 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 DNAJB13P59910 316 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 HERVK_113P63132 956 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 CD47Q08722 323 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 TRIM32Q13049 653 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 KCNAB2Q13303 367 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.09■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 TBX1O43435 398 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 SLC22A3O75751 556 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 CAPN15O75808 1086 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 CYBBP04839 570 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 GPIP06744 558 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 OR10A6Q8NH74 314 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 ABCB7O75027 752 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 RHOBTB1O94844 696 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 EDNRBP24530 442 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.08■□□□□ 0.81
PAXIP1-202ENST00000404141 CDC7O00311 574 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SERPINB1P30740 379 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 DAG1Q14118 895 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SYT16Q17RD7 645 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF560Q96MR9 790 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 HPS4Q9NQG7 708 aa20.08■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 PSMD8P48556 350 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ADAM17P78536 824 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 MADCAM1Q13477 382 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF846Q147U1 533 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 NOTUMQ6P988 496 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SPRED1Q7Z699 444 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 LPPQ93052 612 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 NODALQ96S42 347 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 VPS4AQ9UN37 437 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 PAGE1O75459 146 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 GSNP06396 782 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 CRHBPP24387 322 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 CA8P35219 290 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 MICU2Q8IYU8 434 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 POC5Q8NA72 575 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 FAM162AQ96A26 154 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF347Q96SE7 839 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 VAT1Q99536 393 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 MAF1Q9H063 256 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 BTN3A1O00481 513 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 HRH2P25021 359 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ACADVLP49748 655 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 TMBIM6P55061 237 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.07■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 NDUFS2O75306 463 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SEC24AO95486 1093 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 SENP8Q96LD8 212 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 HGH1Q9BTY7 390 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 ARVCFO00192 962 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 FFAR3O14843 346 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 GPR42O15529 346 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 OR4F21O95013 312 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 HSD17B1P14061 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 PGFP49763 221 aa20.06■□□□□ 0.8
PAXIP1-202ENST00000404141 VAC14Q08AM6 782 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms