RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 NSG1P42857 185 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CRY1Q16526 586 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FAM124AQ86V42 546 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NXNL1Q96CM4 212 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SMOXQ9NWM0 555 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 IGLON5A6NGN9 336 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 IQCF5A8MTL0 148 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PLIN3O60664 434 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TM7SF2O76062 418 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL2O95198 593 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ITGB6P18564 788 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NDUFV2P19404 249 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SERPINB4P48594 390 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.844e-6■■□□□ 12.4
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB16Q05516 673 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DLG1Q12959 904 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC153Q494R4 210 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LCA5Q86VQ0 697 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SIX5Q8N196 739 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MAGEB18Q96M61 343 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 INPP4BO15327 924 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PROCP04070 461 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GPR1P46091 355 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PGBD3Q8N328 593 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 HMGB4Q8WW32 186 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ9Q92806 393 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GALPQ9UBC7 116 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP99D6REC4 459 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 H3BMM5 538 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MTX2O75431 263 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM16O95361 564 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MSH3P20585 1137 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KLC3Q6P597 504 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 DET1Q7L5Y6 550 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KBTBD6Q86V97 674 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GLYATL1Q969I3 302 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FOXQ1Q9C009 403 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MED16Q9Y2X0 877 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FAM170BA6NMN3 283 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 STK25O00506 426 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RALBP11234 206 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GABRG2P18507 467 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SEC24CP53992 1094 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 B4GALNT1Q00973 533 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CREB5Q02930 508 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PDK4Q16654 411 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PELI3Q8N2H9 469 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 VPS35Q96QK1 796 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MECRQ9BV79 373 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FZD4Q9ULV1 537 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms