RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 RGPD5Q99666 1765 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM233B4DJY2 109 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPN1P07384 714 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 RAP2AP10114 183 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PCSK2P16519 638 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOX1Q15067 660 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PARP8Q8N3A8 854 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMG2Q969U7 264 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC3Q9BY71 257 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF4O00268 1085 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4Q2P0C623 313 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TACR2P21452 398 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 C4AP0C0L4 1744 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 C4BP0C0L5 1744 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM163BP0C2L3 166 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 WEE1P30291 646 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SPIBQ01892 262 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCB1Q12824 385 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO19Q96H55 970 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 APOLD1Q96LR9 279 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM234BA2RU67 622 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PPEF2O14830 753 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 GSTM5P46439 218 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM11AP58511 58 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 DET1Q7L5Y6 550 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK20Q8IZL9 346 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 BBS4Q96RK4 519 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 NPY6RQ99463 290 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEH1Q9H213 219 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SPG21Q9NZD8 308 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A088AWK7 358 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BSA7 217 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 HDCP19113 662 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVK-8P63133 956 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDN10P78369 228 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PFKPQ01813 784 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC58Q96CX6 371 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PIPSLA2A3N6 862 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ESR1P03372 595 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 RPN2P04844 631 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBA4AP68366 448 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F2P78329 520 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 GNA12Q03113 381 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNG1Q06432 222 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F3Q08477 520 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 DMPKQ09013 629 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT2Q10471 571 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC73Q6P1J9 531 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 EURLQ9NYK6 297 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SMPD1P17405 629 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT78Q8N1N4 520 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10A6Q8NH74 314 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 TSC22D2O75157 780 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DQB2P05538 268 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA7P48741 367 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF33AQ06730 810 aa16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms