RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SFRP1Q8N474 314 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM71DQ8N9W8 422 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GDAP1Q8TB36 358 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS35Q96QK1 796 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PKP3Q9Y446 797 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 C5orf60A6NFR6 353 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CHUKO15111 745 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 VEGFDO43915 354 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFSF15O95150 251 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CPNE6O95741 557 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR3P46089 330 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 FASLGP48023 281 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRCAPQ14761 206 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 USP53Q70EK8 1073 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PIM3Q86V86 326 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO39Q8N4B4 442 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35B2Q8TB61 432 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KLC4Q9NSK0 619 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL5AQ9Y689 179 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 AGRPO00253 132 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PLD2O14939 933 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 STX7O15400 261 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR39O43194 453 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A9O60656 530 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PPFIA2O75334 1257 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK14O94921 469 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A6P19224 532 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A1P22309 533 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A4P22310 534 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CD1CP29017 333 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A3P35503 534 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A5P35504 534 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SPARCL1Q14515 664 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 INSCQ1MX18 579 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PHF19Q5T6S3 580 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 NKAIN2Q5VXU1 208 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IYDQ6PHW0 289 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRTM4Q86VH4 590 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLITRK4Q8IW52 837 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF248Q8NDW4 579 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TBL1YQ9BQ87 522 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA6CQ9H3T2 930 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 A6NCN8 305 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KMOO15229 486 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC175P0C221 793 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 F3P13726 295 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 HGFP14210 728 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC2A4P14672 509 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LPOP22079 712 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCNKAP51800 687 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GDF10P55107 478 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF2H3Q13889 308 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF547Q8IVP9 402 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC8AQ8IWT6 810 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CRELD1Q96HD1 420 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC38A3Q99624 504 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LZTFL1Q9NQ48 299 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM8Q9NQV8 689 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LOXL2Q9Y4K0 774 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD3Q9Y597 815 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf81A6NN90 581 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CDRT15L2A8MXV6 281 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 METTL18O95568 372 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGA2BP08514 1039 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 JMJD7P0C870 316 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CA5AP35218 305 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 HHEXQ03014 270 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGA9Q13797 1035 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP6Q2NL67 630 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PDZD3Q86UT5 571 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms