RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAPKAPK2P49137 400 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SUOXP51687 545 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 GFERP55789 205 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 APBA1Q02410 837 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FOXM1Q08050 763 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NFATC2Q13469 925 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 LAMB3Q13751 1172 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CYTH1Q15438 398 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 TESK1Q15569 626 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CHRNA6Q15825 494 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 UGT8Q16880 541 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 LCE4AQ5TA78 99 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PNCKQ6P2M8 343 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 GJB7Q6PEY0 223 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 DOK6Q6PKX4 331 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CFAP57Q96MR6 1250 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUDT9Q9BW91 350 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 TEX101Q9BY14 249 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ING2Q9H160 280 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAGEH1Q9H213 219 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACSS2Q9NR19 701 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 STAP1Q9ULZ2 295 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CFAP69A5D8W1 941 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZG16O60844 167 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRCH4O75427 683 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPAG6O75602 509 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRIG2O94898 1065 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 RECKO95980 971 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 F9P00740 461 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 IVLP07476 585 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 TNFAIP3P21580 790 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FUT4P22083 530 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SYKP43405 635 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NOP2P46087 812 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SEPHS1P49903 392 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NDUFA8P51970 172 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NDST2P52849 883 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ITGA1P56199 1179 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDK3Q00526 305 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 HHEXQ03014 270 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDK18Q07002 472 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAPSNQ13702 412 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACOX1Q15067 660 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLCL1Q15111 1095 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 C2CD6Q53TS8 623 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 AFMIDQ63HM1 303 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPPA4Q7L190 304 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM74Q86UV6 250 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 SFRP1Q8N474 314 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 THAP4Q8WY91 577 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 INPP5DQ92835 1189 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 ECHDC3Q96DC8 303 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUS1Q96E22 293 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 MISP3Q96FF7 219 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 COQ10AQ96MF6 247 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR2M4Q96R27 311 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6C1Q96RD1 312 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms