RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 OLFM1Q99784 485 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 RHBGQ9H310 441 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 FETUBQ9UGM5 382 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF711Q9Y462 761 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 MGRN1O60291 552 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 PSMD8P48556 350 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 NEK2P51955 445 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 FAM171BQ6P995 826 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 NRBF2Q96F24 287 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 EBF2Q9HAK2 575 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 TTC3P53804 2025 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 CLPTM1O96005 669 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ITFG1Q8TB96 612 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 POF1BQ8WVV4 589 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 COL26A1Q96A83 441 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 KIFC1Q9BW19 673 aa14.72□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 GRM6O15303 877 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ECI2O75521 394 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 OAZ2O95190 189 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 MLYCDO95822 493 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 SPAM1P38567 509 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 KRT72Q14CN4 511 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 NEDD8Q15843 81 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 APCDD1Q8J025 514 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 OLFM3Q96PB7 478 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 EBF3Q9H4W6 596 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 POMPQ9Y244 141 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 PRAMEF11O60813 436 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 STATHP02808 62 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ACADMP11310 421 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ATP6V1E1P36543 226 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM135Q86UB9 458 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 BATF3Q9NR55 127 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 SLC22A3O75751 556 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 MTA1Q13330 715 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 PLD4Q96BZ4 506 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 OR52E6Q96RD3 313 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 SUFUQ9UMX1 484 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.71□□□□□ -0.05
ZBED1-202ENST00000381222 M0QZQ0 153 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 SLC31A1O15431 190 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 SOD2P04179 222 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 COL6A2P12110 1019 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 PTPN2P17706 415 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 A0A0G2JN53 185 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 ILVBLA1L0T0 632 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CLOCKO15516 846 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 HS6ST1O60243 411 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 STK16O75716 305 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 OTCP00480 354 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CCT8P50990 548 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CACNG1Q06432 222 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CGB2Q6NT52 195 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 Q6ZVL8 140 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.7□□□□□ -0.06
ZBED1-202ENST00000381222 RNF38Q9H0F5 515 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms