RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MYADML2A6NDP7 307 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GPR32O75388 356 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NPPAP01160 153 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ALBP02768 609 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 EPHX1P07099 455 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNGP07510 517 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GJB1P08034 283 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RBP1P09455 135 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 STMN1P16949 149 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PAMP19021 973 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TNFSF9P41273 254 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRIA3P42263 894 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CCT8P50990 548 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACLYP53396 1101 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A2P55011 1212 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RAB10P61026 200 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RBP5P82980 135 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CAP1Q01518 475 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF33AQ06730 810 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRAF2Q12933 501 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PMS2P3Q13401 168 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PKDCCQ504Y2 493 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AGKQ53H12 422 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FGD3Q5JSP0 725 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NOTUMQ6P988 496 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KDM1BQ8NB78 822 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RNF169Q8NCN4 708 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AGR3Q8TD06 166 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY11Q96G91 374 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 VMP1Q96GC9 406 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FAM84AQ96KN4 292 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A18Q96N87 628 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HGH1Q9BTY7 390 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HPS4Q9NQG7 708 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ANK1P16157 1881 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ISPDA4D126 451 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SOCS2O14508 198 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ANGPT2O15123 496 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN1O60635 241 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM23O75077 832 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 VPS4BO75351 444 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DLGAP3O95886 979 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HPRP00739 348 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LDLRP01130 860 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FUCA1P04066 466 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GSTM2P28161 218 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRK3P35626 688 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRIA1P42261 906 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDH15P55291 814 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDH17Q12864 832 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRIK2Q13002 908 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ITGADQ13349 1161 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA7Q13683 1181 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF6Q58WW2 860 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TTC23Q5W5X9 447 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SERINC5Q86VE9 423 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 UNC93AQ86WB7 457 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PROSER1Q86XN7 944 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AADATQ8N5Z0 425 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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