RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF34Q8IZ26 560 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMC1Q8N766 993 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC89Q8N998 374 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMRP1Q8NCR6 262 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5R1Q8NH85 324 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FIG4Q92562 907 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAFAH2Q99487 392 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDOQ99489 341 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA3CQ99985 751 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD21L1Q9H4I0 556 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAREM1Q9H706 876 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIMAP4Q9NUV9 329 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSD3Q9NYI0 1048 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PADI1Q9ULC6 663 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2A25A4D2G3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLOD5A6NK44 160 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC16A5O15375 505 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FIBPO43427 364 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNAB3O43448 404 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLPP2O43688 288 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC28A2O43868 658 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGM3O95394 542 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GH2P01242 217 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGFB3P10600 412 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPREB1P12018 145 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR1B1P15121 316 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOD1P15172 320 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNA5P22460 613 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD52P43351 418 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMAN1P49257 510 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMPHP49418 695 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAT2P52630 851 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRP1P56182 461 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMF1P82094 1093 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG7P83436 770 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUCB1Q02818 461 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC20A2Q08357 652 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPOCK1Q08629 439 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT33BQ14525 404 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF234Q14588 700 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASIC2Q16515 512 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEP1AQ16819 746 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT16Q17RD7 645 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC96Q2M329 555 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF19Q2TAC6 998 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM35AQ53FP2 167 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT79Q5XKE5 535 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRNP1Q6NT89 227 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GFRALQ6UXV0 394 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD6Q86V97 674 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00346Q8IVM7 164 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP7D3Q8IWC1 876 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCUQ8NE86 351 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 APPL2Q8NEU8 664 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BBS10Q8TAM1 723 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGTQ969N2 578 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF21Q96ID5 467 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DACH2Q96NX9 599 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCYT2Q99447 389 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HGH1Q9BTY7 390 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms