RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 FBXO27Q8NI29 283 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 C1orf21Q9H246 121 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CRLF2Q9HC73 371 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 NOTCH4Q99466 2003 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 HCRTO43612 131 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 BCL10O95999 233 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 NFICP08651 508 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 KELP23276 732 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 F8A1P23610 371 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CTNNA2P26232 953 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 MLLT10P55197 1068 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 PCDH1Q08174 1060 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ERV3-1Q14264 604 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ZMYND11Q15326 602 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 RETSATQ6NUM9 610 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 SPATC1Q76KD6 591 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 KIFC1Q9BW19 673 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 IFT46Q9NQC8 304 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ALG6Q9Y672 507 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 TSC2P49815 1807 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 PTPRJQ12913 1337 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 FUT10Q6P4F1 479 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CCR6-202ENST00000349984 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ART5Q96L15 291 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 C9orf72Q96LT7 481 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 THAP2Q9H0W7 228 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 NENFQ9UMX5 172 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.2□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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