RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 DBN1Q16643 649 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GRTP1Q5TC63 336 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LGSNQ5TDP6 509 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 C11orf74Q86VG3 221 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 VPS35Q96QK1 796 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 APOOQ9BUR5 198 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 WDR26Q9H7D7 661 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 FETUBQ9UGM5 382 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TBK1Q9UHD2 729 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.62□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 AGAP14A8MT82 685 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 H0Y8X5 98 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SOD1P00441 154 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CNR2P34972 360 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 IGFALSP35858 605 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM23P36406 574 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ABCG1P45844 678 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CNSTQ6PJW8 725 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM74Q86UV6 250 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TDRPQ86YL5 185 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 RBFAQ8N0V3 343 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 BMFQ96LC9 184 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LGR4Q9BXB1 951 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CLPBQ9H078 707 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.61□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CFAP99D6REC4 459 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SAT1P21673 171 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GP5P40197 560 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CD151P48509 253 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CDK3Q00526 305 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 DOK6Q6PKX4 331 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PACS1Q6VY07 963 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 DET1Q7L5Y6 550 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 BOCQ9BWV1 1114 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TEX101Q9BY14 249 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 EURLQ9NYK6 297 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 RHOBTB1O94844 696 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 CDK14O94921 469 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GABRB3P28472 473 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 NSG1P42857 185 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 THOP1P52888 689 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 MROH9Q5TGP6 573 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 Q6ZSR6 202 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GPATCH11Q8N954 259 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 NAT14Q8WUY8 206 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SGF29Q96ES7 293 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 OR2AG1Q9H205 316 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SMOXQ9NWM0 555 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.6□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 KRT38O76015 456 aa14.59□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 HTR1BP28222 390 aa14.59□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 GTF2H3Q13889 308 aa14.59□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms