RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 SNX12Q9UMY4 172 aa24.84■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 RNF215Q9Y6U7 377 aa24.84■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 LDB2O43679 373 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 INSCQ1MX18 579 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 C4orf22Q6V702 233 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 PATE1Q8WXA2 126 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PDF-201ENST00000288022 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 MYLKQ15746 1914 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CCL22O00626 93 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CHUKO15111 745 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 KMOO15229 486 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SNX2O60749 519 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SUN1O94901 812 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 AKT1P31749 480 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 GNG11P61952 73 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 NAGSQ8N159 534 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ARL14Q8N4G2 192 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 DDHD1Q8NEL9 900 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 WDR48Q8TAF3 677 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 KLC4Q9NSK0 619 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.82■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CCDC78A2IDD5 438 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 RHPN2P1A8MT19 583 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CA5AP35218 305 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SPIDRQ14159 915 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SMOXQ9NWM0 555 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa24.81■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CSO75390 466 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 PROS1P07225 676 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 MSH3P20585 1137 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ITGALP20701 1170 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 GRIA1P42261 906 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CCL7P80098 99 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 XIAPP98170 497 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 NFATC2Q13469 925 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CAMK2BQ13554 666 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CCDC38Q502W7 563 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CCNJLQ8IV13 435 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TBC1D29Q9UFV1 150 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.8■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SPEGQ15772 3267 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ZNF185O15231 689 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TCEA3O75764 348 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 PNLIPP16233 465 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 MC4RP32245 332 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 VPS41P49754 854 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TTC27Q6P3X3 843 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 STYXQ8WUJ0 223 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ULK4Q96C45 1275 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 LRRN3Q9H3W5 708 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SLC23A2Q9UGH3 650 aa24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 OR2AG2A6NM03 316 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 CES2O00748 559 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 EML2O95834 649 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SLC2A4P14672 509 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 VCLP18206 1134 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 TERF1P54274 439 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 LAMB3Q13751 1172 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 DET1Q7L5Y6 550 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SNX20Q7Z614 316 aa24.78■■□□□ 1.56
PDF-201ENST00000288022 SPRED1Q7Z699 444 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.3 ms