RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 ASMTP46597 345 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CTAG1AP78358 180 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ECT2LQ008S8 904 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 AP1B1Q10567 949 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TROAPQ12815 778 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SYCP1Q15431 976 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HHATQ5VTY9 493 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ATG16L1Q676U5 607 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC65Q8IXS2 484 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PLD5Q8N7P1 536 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 IPMKQ8NFU5 416 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RND1Q92730 232 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ELP4Q96EB1 424 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM19Q96HH6 336 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CNDP1Q96KN2 507 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BBS4Q96RK4 519 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SDF4Q9BRK5 362 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EBF2Q9HAK2 575 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GGA3Q9NZ52 723 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.05□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 WDR81Q562E7 1941 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC69A6NI79 296 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 B4DLN1 442 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 H0Y626 953 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 MID1O15344 667 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SLC7A4O43246 635 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RTN2O75298 545 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GOSR1O95249 250 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 STAMBPO95630 424 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ETFAP13804 333 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GPTP24298 496 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HADHAP40939 763 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DCAF7P61962 342 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GRIK3Q13003 919 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EFR3AQ14156 821 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BECN1Q14457 450 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 NEDD9Q14511 834 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PPA1Q15181 289 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC80Q76M96 950 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 FBXO30Q8TB52 745 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC114Q96M63 670 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UHRF2Q96PU4 802 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HAUS8Q9BT25 410 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 C1RLQ9NZP8 487 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1456Q9P272 454 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HSF4Q9ULV5 492 aa3.04□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CAPN9O14815 690 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ZBED4O75132 1171 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 RFPL2O75678 378 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 BAG4O95429 457 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 TBX18O95935 607 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CRYAAP02489 173 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 G6PDP11413 515 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 ATP1A3P13637 1013 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CD58P19256 250 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 USP8P40818 1118 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 HNF4AP41235 474 aa3.03□□□□□ -1.92
GPBP1-201ENST00000264779 CLCN3P51790 818 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms