RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 C3orf14Q9HBI5 128 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 C8orf4Q9NR00 106 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AP4B1Q9Y6B7 739 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TAF1P21675 1872 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PER2O15055 1255 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TM7SF2O76062 418 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MAPK10P53779 464 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MTAPQ13126 283 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SLC9A5Q14940 896 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MAPK11Q15759 364 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FSTL4Q6MZW2 842 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 KLHL35Q6PF15 583 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AZIN2Q96A70 460 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PLD4Q96BZ4 506 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 NMUR1Q9HB89 426 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MIOSQ9NXC5 875 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 STBD1O95210 358 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PRAMEF1O95521 474 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 APODP05090 189 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FAM163BP0C2L3 166 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 WNT7BP56706 349 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ADCY4Q8NFM4 1077 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SGK2Q9HBY8 427 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MYO9BQ13459 2157 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM43BA6NCK2 446 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 OR10H3O60404 316 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CCNDBP1O95273 360 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TRBC1P01850 177 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ESR1P03372 595 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ITPKAP23677 461 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MSS51Q4VC12 460 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LINGO4Q6UY18 593 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 GK5Q6ZS86 529 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CPA6Q8N4T0 437 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 BRSK1Q8TDC3 778 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TWIST2Q8WVJ9 160 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AP2M1Q96CW1 435 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HMCESQ96FZ2 354 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CAPNS2Q96L46 248 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 GSAPA4D1B5 854 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CA12O43570 354 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FGBP02675 491 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MANFP55145 182 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CSNK2BP67870 215 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RIPK1Q13546 671 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 COMMD2Q86X83 199 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CRYBG2Q8N1P7 616 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SCAMP5Q8TAC9 235 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SLC35F5Q8WV83 523 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FEM1CQ96JP0 617 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HAPLN3Q96S86 360 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MYOCQ99972 504 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 IPPKQ9H8X2 491 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SIN3BO75182 1162 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PGM3O95394 542 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RPIAP49247 311 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CLCQ05315 142 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TCEAL1Q15170 157 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CLEC20AQ6ZU45 233 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CHST9Q7L1S5 443 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms