RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259154.8

KCTD3-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD3, Length 3,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-201ENST00000259154 GMEB1Q9Y692 573 aa14.76□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 H3BMQ9 156 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 OR4F21O95013 312 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SNX4O95219 450 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CD83Q01151 205 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SMU1Q2TAY7 513 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 RRM2BQ7LG56 351 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 C14orf80Q86SX3 495 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 COG8Q96MW5 612 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 YME1L1Q96TA2 773 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SEMA3CQ99985 751 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 EMCNQ9ULC0 261 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 A8MT66 165 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 PLOD3O60568 738 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TP53BP2Q13625 1128 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 KYAT1Q16773 422 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NACC2Q96BF6 587 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 EVPLQ92817 2033 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TSPAN9O75954 239 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CD36P16671 472 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 PRDX6P30041 224 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 BLVRAP53004 296 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 OXCT1P55809 520 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CD300CQ08708 224 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NFATC3Q12968 1075 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 BNIP2Q12982 314 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 NAB1Q13506 487 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 MOGQ16653 247 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TLK2Q86UE8 772 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 HSFY1Q96LI6 401 aa14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SDHDO14521 159 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 AIREO43918 545 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 HIST1H2ADP20671 130 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CREB5Q02930 508 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 GRB7Q14451 532 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 MAVSQ7Z434 540 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 GPR180Q86V85 440 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 LRRC58Q96CX6 371 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 FEM1CQ96JP0 617 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 OR52E6Q96RD3 313 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 REEP1Q9H902 201 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 PRELID1Q9Y255 219 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 KCTD3Q9Y597 815 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 KRBA1A5PL33 1030 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 FAM25AB3EWG3 89 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 FAM25CB3EWG5 89 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 FAM25GB3EWG6 89 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SMIM18P0DKX4 95 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 IGFBP5P24593 272 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 OR1E1P30953 314 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 S100A3P33764 101 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 UFM1P61960 85 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 RFX4Q33E94 735 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KCTD3-201ENST00000259154 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms