RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 NMUR1Q9HB89 426 aa16.34■□□□□ 0.21
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LAMC1-201ENST00000258341 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.23e-31■■□□□ 14.2
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LAMC1-201ENST00000258341 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 EML1O00423 815 aa16.32■□□□□ 0.2
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LAMC1-201ENST00000258341 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PER2O15055 1255 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LIASO43766 372 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6V0D1P61421 351 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PIGZQ86VD9 579 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF567Q8N184 647 aa16.32■□□□□ 0.2
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