RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 COG4Q9H9E3 785 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PARD6AQ9NPB6 346 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ARL5AQ9Y689 179 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.6□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0J9YYE9 177 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GYG2O15488 501 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 VPS26AO75436 327 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TRBC1P01850 177 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ASLP04424 464 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PDHA1P08559 390 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 THRAP10827 490 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CD1DP15813 335 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GLDCP23378 1020 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IRX4P78413 519 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IRF9Q00978 393 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LMAN2Q12907 356 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TRAF2Q12933 501 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TUBB3Q13509 450 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CCINQ13939 588 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GALNT3Q14435 633 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SNCBQ16143 134 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LPAL2Q16609 132 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CARD16Q5EG05 197 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CES4AQ5XG92 561 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ACAD11Q709F0 780 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TTC16Q8NEE8 873 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CEP70Q8NHQ1 597 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LPGAT1Q92604 370 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 DNASE1L2Q92874 299 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CHRDQ9H2X0 955 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SPHK2Q9NRA0 654 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 NDE1Q9NXR1 346 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 OBP2AQ9NY56 170 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 XPR1Q9UBH6 696 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SPEGQ15772 3267 aa10.59□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CHD5Q8TDI0 1954 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 STX16O14662 325 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 HRO43593 1189 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 KLK8O60259 260 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 SNAP91O60641 907 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 LILRB5O75023 590 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 EZRP15311 586 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 SAT1P21673 171 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 OPRD1P41143 372 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 SLC6A11P48066 632 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 RAP1GDS1P52306 607 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 IL2P60568 153 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 XIAPP98170 497 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ECT2LQ008S8 904 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 DLG1Q12959 904 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 GRIK2Q13002 908 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 CSHL1Q14406 222 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 CDKN3Q16667 212 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 EML3Q32P44 896 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 SNX20Q7Z614 316 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 APCDD1Q8J025 514 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CDCA3-201ENST00000229265 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms