RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxj1Q61660 421 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 InavaQ7TN12 663 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syt14Q7TN84 555 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r213Q8R278 384 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr697Q8VFM4 317 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SardhQ99LB7 919 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efhc1Q9D9T8 648 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cog8Q9JJA2 640 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nipa2Q9JJC8 359 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpc4apQ9JLV2 797 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nme4Q9WV84 186 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eml5Q8BQM8 1977 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp952B0V2W4 504 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Erich1E9PY43 332 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RpsaP14206 295 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc3P59034 257 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pip5k1bP70181 539 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfyve27Q3TXX3 415 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lcp2Q60787 533 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itga7Q61738 1179 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif2b4Q61749 524 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lemd2Q6DVA0 511 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif18bQ6PFD6 834 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp8Q80U87 1080 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mettl3Q8C3P7 580 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ftsj1Q8CBC7 324 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stx5Q8K1E0 355 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DolkQ8R2Y3 534 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkal1Q91WE6 578 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpina3nQ91WP6 418 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spred2Q924S7 410 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MpstQ99J99 297 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GsdmcQ99NB5 468 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam136aQ9CR98 138 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Moxd1Q9CXI3 613 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpysl5Q9EQF6 564 aa10.15□□□□□ -0.78
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ralgps1A2AR50 585 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem215A7E1Z1 235 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap36B1AUC7 590 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gnat1P20612 350 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnj9P48543 393 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpc4P51655 557 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hcrtr1P58307 416 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RalgdsQ03385 852 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgap2Q3TQR0 254 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glb1l2Q3UPY5 636 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxr1Q3UTB7 268 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam126aQ6P9N1 521 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trit1Q80UN9 467 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nsl1Q8K305 281 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r205Q8R276 316 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taf12Q8VE65 161 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oas1cQ924S2 362 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akr1e2Q9DCT1 301 aa10.15□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A286YCD0 109 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r3A2AMT7 306 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbed6D2EAC2 980 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf169E9Q7F2 694 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tsga10ipF7A1F0 157 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm2832F7AEC7 200 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdha2P35487 391 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pde7aP70453 456 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxk2Q3UCQ1 651 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hesx1Q61658 185 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VwdeQ6DFV8 926 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr17Q6NS65 339 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pqlc1Q80XM9 271 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abi3Q8BYZ1 367 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r79Q8R285 306 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr448Q8VES9 310 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mlf2Q99KX1 247 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P33monoxQ9DBN4 303 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RhoaQ9QUI0 193 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt6bQ9Z331 562 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr292F8VQ84 308 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r57L7N269 863 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Top3aO70157 1003 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms