RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem173Q3TBT3 378 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RubcnQ80U62 956 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nox1Q8CIZ9 591 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TraipQ8VIG6 470 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slco6d1Q9D5W6 683 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlr6Q9EPW9 795 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prmt1Q9JIF0 371 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tuba8Q9JJZ2 449 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B9d1Q9R1S0 204 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lcn6A2AJB9 181 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Calhm3J3QMI4 347 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PthlhP22858 175 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ceacam5Q3UKK2 947 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf784Q8BI69 297 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtg1Q8R2R6 326 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RhoqQ8R527 205 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr183Q8VFB9 309 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr847Q8VFF4 312 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AasdhpptQ9CQF6 309 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbpl10S4R1M9 766 aa16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim30bE9PVL6 203 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RfngO09009 332 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brsk1Q5RJI5 778 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RadilQ69Z89 1099 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rxfp4Q7TQP4 414 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sept8Q8CHH9 429 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atg10Q8R1P4 215 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrf1Q8VEC3 908 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1352Q8VGX5 309 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TmlheQ91ZE0 421 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmtm6Q9CZ69 183 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmbim6Q9D2C7 237 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc13a2Q9ES88 586 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cilp2D3Z7H8 1162 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncam2O35136 837 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eno2P17183 434 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Traf2P39429 501 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jak3Q62137 1100 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhga7Q6DD96 935 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BP99 230 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kyat1Q8BTY1 424 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrch3Q8BVU0 778 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rprd1aQ8VDS4 312 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr273Q8VG87 317 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr589Q8VGV8 317 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NlnQ91YP2 704 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmc1Q9CPZ8 106 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dph2Q9CR25 489 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il1rl2Q9ERS7 574 aa16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mcf2A2AEU1 1111 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dthd1E9PZX1 795 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfr2E9Q5M4 874 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3642K7N6V4 267 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcl7cO08664 217 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Capn5O08688 640 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClockO08785 855 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pbx3O35317 434 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp2O88623 613 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hrh1P70174 488 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pitx1P70314 315 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hhla1Q3TYV2 514 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbp2Q5QNQ6 908 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a4Q60857 630 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8CDN1 933 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox18Q8VC74 331 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EedQ921E6 441 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oas1cQ924S2 362 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St7Q99M96 577 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CpqQ9WVJ3 470 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp938E9Q9G3 579 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GzmkO35205 263 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aff2O55112 1272 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tap1P21958 724 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr2iP60898 125 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm1604bQ3TRG0 118 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5800Q497L3 186 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itga2Q62469 1178 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slain1Q68FF7 579 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr834Q7TRG8 312 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Morc4Q8BMD7 928 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sfr1Q8BP27 319 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acsl5Q8JZR0 683 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lurap1lQ8K2P1 221 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ca9Q8VHB5 437 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frmd4bQ920B0 1035 aa16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms