RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SOCS2	O14508	198 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ASGR1	P07306	291 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	DPP6	P42658	865 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	GSK3B	P49841	420 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	LCP2	Q13094	533 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	OPTC	Q9UBM4	332 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR39	O43194	453 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1I1	O60431	355 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CDK14	O94921	469 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	FGF1	P05230	155 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RHOQ	P17081	205 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	MTHFR	P42898	656 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD23A	P54725	363 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	HERVK_113	P63132	956 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	GNA12	Q03113	381 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	PWP1	Q13610	501 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1D2	Q14995	579 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	DACH2	Q96NX9	599 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC3	P53804	2025 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A4	O43246	635 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ULK1	O75385	1050 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	FTH1	P02794	183 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	IST1	P53990	364 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP9	P55211	416 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	LSAMP	Q13449	338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD51B	O15315	384 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ECI2	O75521	394 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGAL	P20701	1170 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A1	P22309	533 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A4	P22310	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A3	P35503	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A5	P35504	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	C7orf72	A4D263	438 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SNAP29	O95721	258 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	HK2	P52789	917 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	TNK2	Q07912	1038 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPRR	Q15256	657 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525		H3BNX3	289 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-223	ENST00000639525	NDST3	O95803	873 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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