RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 HERC3Q15034 1050 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 C5orf22Q49AR2 442 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM198Q66K66 360 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 RNF148Q8N7C7 305 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TFAP2CQ92754 450 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 KRBA1A5PL33 1030 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 ATF6P18850 670 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 ACAP2Q15057 778 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 ASB9Q96DX5 294 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 FEM1CQ96JP0 617 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TBATAQ96M53 351 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.34■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 A8MT66 165 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 H7C4K7 107 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 J3QRK9 145 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CFLARO15519 480 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 EPOP01588 193 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 RBP1P09455 135 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 NEK2P51955 445 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CDKN2DP55273 166 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TCTN1Q2MV58 587 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 LGI2Q8N0V4 545 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC15A4Q8N697 577 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 FBXL8Q96CD0 374 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC126Q96EE4 140 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.33■□□□□ 0.85
HDGFL2-208ENST00000616600 A0A0D9SEW6 157 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 F5H5T6 163 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TRIM38O00635 465 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 INHAP05111 366 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PTPN2P17706 415 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 HLA-DPA1P20036 260 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC6A4P31645 630 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF235Q14590 738 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 NXNQ6DKJ4 435 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TOP1MTQ969P6 601 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TAMM41Q96BW9 452 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PSD2Q9BQI7 771 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 NACA2Q9H009 215 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.33■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 FGF1P05230 155 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 JAK1P23458 1154 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 OXA1LQ15070 435 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PHKG1Q16816 387 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PEX13Q92968 403 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ACDQ96AP0 544 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC138Q96M89 665 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF599Q96NL3 588 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TTPALQ9BTX7 342 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ARL5AQ9Y689 179 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SDHDO14521 159 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 AKAP10O43572 662 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ACSL4O60488 711 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PSMD8P48556 350 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 RHDQ02161 417 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PMS2P3Q13401 168 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PTPRCAPQ14761 206 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 RAB39AQ14964 217 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 MTX3Q5HYI7 312 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 GPR107Q5VW38 600 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.32■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.31■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.31■□□□□ 0.84
HDGFL2-208ENST00000616600 PFDN6O15212 129 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms