RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYLKQ15746 1914 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM92AA1XBS5 289 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM172BPA6NC97 362 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MROH6A6NGR9 719 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLDN24A6NM45 220 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WASH4PA8MWX3 477 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 G3V2T6 193 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC1A7O00341 560 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STX16O14662 325 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPEF2O14830 753 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PIP5K1BO14986 540 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MATN3O15232 486 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 B4GAT1O43505 415 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CA12O43570 354 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TBC1D4O60343 1298 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAFKO60675 156 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HUS1O60921 280 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC22A3O75751 556 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UPK1BO75841 260 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRKD3O94806 890 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 INMTO95050 263 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNH1O95259 989 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARIH2O95376 493 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYBBP04839 570 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GSNP06396 782 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GJB1P08034 283 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANXA6P08133 673 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HGFP14210 728 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARSAP15289 507 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNE1P15382 129 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD1DP15813 335 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TCF3P15923 654 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NPR3P17342 541 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHRM3P20309 590 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SAT1P21673 171 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD9P21926 228 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FDXRP22570 491 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPS12P25398 132 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSMA3P25788 255 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LMO2P25791 158 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NFKBIAP25963 317 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADORA2BP29275 332 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ETV6P41212 452 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCYT1AP49585 367 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLCN3P51790 818 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PGGT1BP53609 377 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNK10P57789 538 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DAOAP59103 153 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CSNK2BP67870 215 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TUBA1BP68363 451 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDC42EP1Q00587 391 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHRNB3Q05901 458 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CXCL9Q07325 125 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD47Q08722 323 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADIGQ0VDE8 80 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDK5R2Q13319 367 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LAMC2Q13753 1193 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NFYCQ13952 458 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GEN1Q17RS7 908 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LY6KQ17RY6 165 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIF19Q2TAC6 998 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMU1Q2TAY7 513 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PYCR3Q53H96 274 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MANEALQ5VSG8 457 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF280DQ6N043 979 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KDELC1Q6UW63 502 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms