RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	MZB1	Q8WU39	189 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ISL2	Q96A47	359 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TLCD1	Q96CP7	247 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	OMD	Q99983	421 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SMOX	Q9NWM0	555 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		H3BQF6	201 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GDF9	O60383	454 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PYGL	P06737	847 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	KCNA4	P22459	653 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GABRB3	P28472	473 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	DPP6	P42658	865 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SLC1A2	P43004	574 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PTGER3	P43115	390 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SLCO1A2	P46721	670 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CD151	P48509	253 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	LIG3	P49916	1009 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R38	P59533	333 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CTBP1	Q13363	440 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	NFATC2	Q13469	925 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ITIH4	Q14624	930 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TRABD2A	Q86V40	505 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CYP4X1	Q8N118	509 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TCEAL3	Q969E4	200 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ARL8A	Q96BM9	186 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PP55	124 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	HMX2	A2RU54	273 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		A8MX80	341 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	C10orf142	B7Z368	130 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	NEMP1	O14524	444 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SLC30A4	O14863	429 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GM2A	P17900	193 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	TEAD1	P28347	426 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	PML	P29590	882 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SLC18A1	P54219	525 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		Q6ZVL8	140 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	DTD2	Q96FN9	168 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	GPR22	Q99680	433 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	ASB8	Q9H765	288 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SPTBN2	O15020	2390 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0U1RQS6	177 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	OR51F1	A6NGY5	319 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392	SMIM23	A6NLE4	172 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CELF4-222	ENST00000601392		A6NNZ2	444 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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