RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HGSNATQ68CP4 663 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP85Q9BW27 656 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83DQ9H4H8 585 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RELNP78509 3460 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 GRID2O43424 1007 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NUAK1O60285 661 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A4P14672 509 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CA4P22748 312 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNCP24863 283 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 GFERP55789 205 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 QPCTQ16769 361 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf46Q6P387 395 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FATE1Q969F0 183 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TSGA13Q96PP4 275 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD9Q9H257 536 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD2L2Q9NZM6 624 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 OGFRQ9NZT2 677 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN10Q9UBB4 475 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 AMACRQ9UHK6 382 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTH6 734 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA5A6NI73 299 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD34CP0C6C1 535 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF28P17035 718 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TCN2P20062 427 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 F8A1P23610 371 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 GJC1P36383 396 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ESX1Q8N693 406 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41L1Q9H4G0 881 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC18AA5D8T8 446 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP1A2P05177 515 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP2P08253 660 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MC1RQ01726 317 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GBE1Q04446 702 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP7Q14244 749 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC18BQ6UXF7 455 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXDC1Q8IUK5 500 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC18CQ8NCF0 446 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 EID2BQ96D98 161 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf72Q96LT7 481 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ULBP3Q9BZM4 244 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5K4A6NMS3 321 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 C9P02748 559 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXM1Q08050 763 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP4Q96PP9 640 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF670Q9BS34 389 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2AG1Q9H205 316 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 KLC4Q9NSK0 619 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 DTLQ9NZJ0 730 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 RGSL1A5PLK6 1076 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR19A6NJB7 356 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TYRP1P17643 537 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CD86P42081 329 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCNKAP51800 687 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT3Q14435 633 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ALS2CLQ60I27 953 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CRTC3Q6UUV7 619 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 AVL9Q8NBF6 648 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 UCK1Q9HA47 277 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAAQ9Y263 795 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNMB2Q9Y691 235 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1FO00160 1098 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1D1P20393 614 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BP2P78314 561 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT6Q14141 434 aa25.29■■□□□ 1.64
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