RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf27AQ580R0 203 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF534Q76KX8 674 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 KCNMB4Q86W47 210 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 OR4L1Q8NH43 312 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TTC8Q8TAM2 541 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GANCQ8TET4 914 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN23Q96B33 292 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FAM129BQ96TA1 746 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 EPC1Q9H2F5 836 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TREX1Q9NSU2 369 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SYBUQ9NX95 663 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 IL17CQ9P0M4 197 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CKAP5Q14008 2032 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 A6NHS1 94 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FAM159BA6NKW6 160 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 F8W735 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 WNT9AO14904 365 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 LDB2O43679 373 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFS3O75489 264 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 VAPBO95292 243 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 APBB3O95704 486 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 EGFP01133 1207 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ESR1P03372 595 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MYBL2P10244 700 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CHRNB1P11230 501 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ADRB3P13945 408 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TPH1P17752 444 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CRABP2P29373 138 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 HNF1BP35680 557 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SPAM1P38567 509 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SLC26A3P40879 764 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PTGER3P43115 390 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RGRP47804 291 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CLCN5P51795 746 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 STC1P52823 247 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TFF2Q03403 129 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 DPTQ07507 201 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT3Q14435 633 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ITIH4Q14624 930 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CNGA3Q16281 694 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SNX20Q7Z614 316 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RASSF3Q86WH2 238 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FBF1Q8TES7 1133 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TP53INP1Q96A56 240 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 APOL2Q9BQE5 337 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms