RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582486.5

GGA3-213, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene GGA3, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-213	ENST00000582486	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486		H0YHG0	523 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CD9	P21926	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ACRV1	P26436	265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IDH3A	P50213	366 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GRM2	Q14416	872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ARMCX1	Q9P291	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486		F8W8V4	182 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NPHS1	O60500	1241 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	C1S	P09871	688 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	HLA-E	P13747	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63	2e-7	■■■■□ 23.5
GGA3-213	ENST00000582486	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CLCN7	P51798	805 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TUBB3	Q13509	450 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	MYADM	Q96S97	322 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TTC1	Q99614	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CLPB	Q9H078	707 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	UBXN8	O00124	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TSPAN12	O95859	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	MTHFD2	P13995	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TIMP2	P16035	220 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SPINT3	P49223	89 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PTPN5	P54829	565 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CDC7	O00311	574 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	MATN2	O00339	956 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SMIM24	O75264	130 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ATP5H	O75947	161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SERPINA6	P08185	405 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ITGB6	P18564	788 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IMPDH1	P20839	514 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IL2	P60568	153 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RUNX3	Q13761	415 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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