RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SLC1A1P43005 524 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTGER3P43115 390 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC11A1P49279 550 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCR5P51681 352 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARSEP51690 589 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AIF1P55008 147 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 POLE2P56282 527 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RAB4BP61018 213 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEP78395 509 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PMP22Q01453 160 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 UBE3AQ05086 875 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF543Q08ER8 600 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NOGQ13253 232 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PMS2P3Q13401 168 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MAMLD1Q13495 774 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTK6Q13882 451 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CAPSQ13938 189 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DGKDQ16760 1214 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KYAT1Q16773 422 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TXNRD1Q16881 649 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MPEG1Q2M385 716 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HFEQ30201 348 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CMPK2Q5EBM0 449 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MPP7Q5T2T1 576 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 UTS2BQ765I0 119 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CHST3Q7LGC8 479 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FGD2Q7Z6J4 655 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PXKQ7Z7A4 578 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VASH2Q86V25 355 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM131BQ86XD5 332 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DDIASQ8IXT1 998 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MIER2Q8N344 545 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LCORLQ8N3X6 602 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SNX31Q8N9S9 440 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GPR156Q8NFN8 814 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR5T1Q8NG75 326 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SETD6Q8TBK2 473 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LIPHQ8WWY8 451 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NELFBQ8WX92 580 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DPF1Q92782 380 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRN2Q92932 1015 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF14Q92956 283 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AZIN2Q96A70 460 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PGM2Q96G03 612 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OLFM3Q96PB7 478 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR1F2PQ96R84 312 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB18Q99592 522 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TEX12Q9BXU0 123 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CUEDC2Q9H467 287 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms