RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 FMO1Q01740 532 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDR2Q01850 454 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRAF2Q12933 501 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTP4A2Q12974 167 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF235Q14590 738 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAN2A1Q16706 1144 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRC66Q68CR7 880 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 SYVN1Q86TM6 617 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF677Q86XU0 584 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 COX14Q96I36 57 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 SMIM14Q96QK8 99 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 STK33Q9BYT3 514 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ITPR3Q14573 2671 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD62A6NC57 917 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR5K4A6NMS3 321 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF185O15231 689 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 HTR7P34969 479 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTGIRP43119 386 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTSQ03393 145 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 VWA3BQ502W6 1294 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUDT9Q9BW91 350 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 VPS16Q9H269 839 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDE7BQ9NP56 450 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGLSO95336 258 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 VIPP01282 170 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PYGLP06737 847 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERCC2P18074 760 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK18Q07002 472 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CA9Q16790 459 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGBD5Q8N414 524 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NPWQ8N729 165 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 AVL9Q8NBF6 648 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 C3orf20Q8ND61 904 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 MCEEQ96PE7 176 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RANBP9Q96S59 729 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 VPS18Q9P253 973 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RARRES3Q9UL19 164 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDZD2O15018 2839 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEACAM4O75871 244 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAXP61244 160 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDE1BQ01064 536 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBB3Q13509 450 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAPSNQ13702 412 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 IRGCQ6NXR0 463 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 RFX8Q6ZV50 586 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NLRP8Q86W28 1048 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 IQCKQ8N0W5 287 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNPY3Q9BT09 278 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 UCK1Q9HA47 277 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLC4Q9NSK0 619 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NF1P21359 2839 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 GRID2O43424 1007 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 CALB1P05937 261 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDHA1P08559 390 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOLR1P15328 257 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms