RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SNX20Q7Z614 316 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP8Q86W28 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC6Q86X45 466 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SYT12Q8IV01 421 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 GPR150Q8NGU9 434 aa6.65□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 TCEAL3Q969E4 200 aa6.65□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.65□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 FPGTO14772 594 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 RAD51BO15315 384 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 UGT1A9O60656 530 aa6.64□□□□□ -1.35
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PRPF8-210ENST00000574217 PNCKQ6P2M8 343 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 LAYNQ6UX15 382 aa6.64□□□□□ -1.35
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PRPF8-210ENST00000574217 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF8-210ENST00000574217 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.64□□□□□ -1.35
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