RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GAMT	Q14353	236 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IL11RA	Q14626	422 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SHB	Q15464	509 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CES4A	Q5XG92	561 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2CL	Q68D20	193 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFM4	Q6UX06	510 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf99	Q6UX52	265 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GBP6	Q6ZN66	633 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	P3H2	Q8IVL5	708 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP21	Q8N119	569 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AFAP1	Q8N556	730 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PLD5	Q8N7P1	536 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	WDFY2	Q96P53	400 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2A14	Q96R47	310 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3GL2	Q99962	352 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TM2D2	Q9BX73	214 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR88	Q9GZN0	384 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP1	Q9NVV9	213 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	COX16	Q9P0S2	106 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HAO1	Q9UJM8	370 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CHKB	Q9Y259	395 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GVM2	712 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AGAP5	A6NIR3	686 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NL46	340 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf81	A6NN90	581 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QYT0	321 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	UBXN8	O00124	270 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GRM8	O00222	908 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CA12	O43570	354 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LIAS	O43766	372 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HS6ST1	O60243	411 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	USP12	O75317	370 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPP	P05187	535 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPPL2	P10696	532 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF1	P10914	325 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GPT	P24298	496 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PON1	P27169	355 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FMO4	P31512	558 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMP	P49913	170 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HNMT	P50135	292 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP8	P85298	464 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP4	Q01664	338 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK18	Q07002	472 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL9	Q07325	125 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PGM5	Q15124	567 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC18A3	Q16572	532 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ST3GAL2	Q16842	350 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HFE	Q30201	348 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		2.83	□□□□□ -1.96

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