RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 GDAP1Q8TB36 358 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSNARE1Q96NA8 513 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHRDQ9H2X0 955 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.11■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLRA3O75311 464 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDH8O95206 1070 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GABRG2P18507 467 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACRV1P26436 265 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRABP2P29373 138 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRHR1P34998 444 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA5AP35218 305 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GMPRP36959 345 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC18A1P54219 525 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNGT1P63211 74 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGBL4Q5VU57 503 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF549Q6P9A3 640 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP30Q70CQ3 517 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 KBTBD6Q86V97 674 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGBD3Q8N328 593 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPEM1Q8N4L4 309 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 OLFM1Q99784 485 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH19Q9H159 772 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCG8Q9H221 673 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRID1Q9ULK0 1009 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACOT9Q9Y305 439 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP1G1O43747 822 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHOBTB1O94844 696 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6P13671 934 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCDC1P59894 354 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 IRF9Q00978 393 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBFAQ8N0V3 343 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NXPE1Q8N323 547 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM136AQ96C01 138 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ULK4Q96C45 1275 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP2M1Q96CW1 435 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 COQ10AQ96MF6 247 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 IER2Q9BTL4 223 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLPBQ9H078 707 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPAMQ9HCL2 828 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 MKS1Q9NXB0 559 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 FZD4Q9ULV1 537 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLLPQ9Y342 182 aa17.1■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPAN6O43657 245 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PKMP14618 531 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEA9P43362 315 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDKN2DP55273 166 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAM1L1Q8N609 369 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC63Q8NA47 563 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUS1Q96E22 293 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DTD2Q96FN9 168 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 BOCQ9BWV1 1114 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 BPTFQ12830 3046 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCOR1O75376 2440 aa17.09■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NNZ2 444 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 E5RI56 91 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJC6O75061 913 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35E2BP0CK96 405 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHRM3P20309 590 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 IRX4P78413 519 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL9RQ01113 521 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 C16orf46Q6P387 395 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR14C36Q8NHC7 312 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 BIRC8Q96P09 236 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 COPS8Q99627 209 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF358Q9NW07 568 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.08■□□□□ 0.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms