RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 SMIM14Q96QK8 99 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 EPN3Q9H201 632 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RQS6 177 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CST8O60676 142 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CLDN7O95471 211 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CPNE6O95741 557 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 EPOP01588 193 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CASRP41180 1078 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SPINT3P49223 89 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 COPS2P61201 443 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 22.2
CS-221ENST00000550734 KCNAB2Q13303 367 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 LRP8Q14114 963 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PHF19Q5T6S3 580 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 NPNTQ6UXI9 565 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PIM3Q86V86 326 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 WDR24Q96S15 920 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 VAT1Q99536 393 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 GLOD4Q9HC38 313 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RAD18Q9NS91 495 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 VPS18Q9P253 973 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SUFUQ9UMX1 484 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 NOTCH2Q04721 2471 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RCCD1A6NED2 376 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PJA2O43164 708 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CCL4P13236 92 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PTPN3P26045 913 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PTPN7P35236 360 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ADCY8P40145 1251 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 POLE2P56282 527 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 DCDC1P59894 354 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CDK18Q07002 472 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ADCY2Q08462 1091 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 WASHC5Q12768 1159 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 XRCC4Q13426 336 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PYCR3Q53H96 274 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 BBS12Q6ZW61 710 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 P3H4Q92791 437 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 EID2BQ96D98 161 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 AGAP3Q96P47 875 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 TAAR9Q96RI9 348 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 AGAP2Q99490 1192 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 RDH14Q9HBH5 336 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CD84Q9UIB8 345 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 HACD1B0YJ81 288 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 B4DGG1 531 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-221ENST00000550734 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms