RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 CCNJLQ8IV13 435 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CARD9Q9H257 536 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 RMI1Q9H9A7 625 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 IL17CQ9P0M4 197 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LRIT1Q9P2V4 623 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 AK5Q9Y6K8 562 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ADAMTS20P59510 1910 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ZFHX4Q86UP3 3567 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 UNC13CQ8NB66 2214 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ITPR1Q14643 2758 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 EML2O95834 649 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GDF10P55107 478 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 NR1D2Q14995 579 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 MEI1Q5TIA1 1274 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ARL14Q8N4G2 192 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 FAM71DQ8N9W8 422 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 VPS35Q96QK1 796 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 APOL2Q9BQE5 337 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LRRN3Q9H3W5 708 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TRIM39Q9HCM9 518 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 IL26Q9NPH9 171 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LAMA5O15230 3695 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GRID2O43424 1007 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 BUD23O43709 281 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 MPOP05164 745 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SPAM1P38567 509 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GABREP78334 506 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 B4GALNT1Q00973 533 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PEX6Q13608 980 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PRPSAP1Q14558 356 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 DENND5AQ6IQ26 1287 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GRAMD1AQ96CP6 724 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TMEM121Q9BTD3 319 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 OR2AG1Q9H205 316 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LZTFL1Q9NQ48 299 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PMS2P1A4D2B8 440 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 A6NCN8 305 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GPR89AB7ZAQ6 455 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CHUKO15111 745 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GPR39O43194 453 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 MTX2O75431 263 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 DXOO77932 396 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 METTL18O95568 372 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GPR89BP0CG08 455 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ACP5P13686 325 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CA5AP35218 305 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LSSP48449 732 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PTPRCAPQ14761 206 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 KCTD11Q693B1 232 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SLC37A2Q8TED4 501 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 RTP4Q96DX8 246 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TBC1D29Q9UFV1 150 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SATB2Q9UPW6 733 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 KCNK6Q9Y257 313 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ARL5AQ9Y689 179 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PPM1DO15297 605 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 LIASO43766 372 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 RPS6KA1Q15418 735 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 CHRNA6Q15825 494 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 PARP6Q2NL67 630 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 IGF2-ASQ6U949 168 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 FAM151BQ6UXP7 276 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-219ENST00000550655 SFRP1Q8N474 314 aa17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms