RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 B5MCH6 92 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 E7EVH7 732 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 H7C0C1 242 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 I6L893 689 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MCF2LO15068 1137 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TRIM24O15164 1050 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLC16A6O15403 523 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 B3GALT2O43825 422 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LPXNO60711 386 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BANF1O75531 89 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TMEM63AO94886 807 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACSL3O95573 720 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ABHD2P08910 425 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CREB1P16220 341 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BDNFP23560 247 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAGEA6P43360 314 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLCO1A2P46721 670 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ATP5OP48047 213 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ROR1Q01973 937 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PPARDQ03181 441 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GBE1Q04446 702 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DSC1Q08554 894 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 XRCC4Q13426 336 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KCNJ11Q14654 390 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN26Q16670 478 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LONRF1Q17RB8 773 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DCAF6Q58WW2 860 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZNF529Q6P280 563 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HOOK3Q86VS8 718 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 METTL23Q86XA0 190 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM131BQ86XD5 332 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HASPINQ8TF76 798 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAML1Q92585 1016 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MYLPFQ96A32 169 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM149B1Q96BN6 582 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CENPTQ96BT3 561 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CLUHO75153 1309 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CFAP69A5D8W1 941 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 C5orf60A6NFR6 353 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SMIM23A6NLE4 172 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM72CH0Y354 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 H3BUI4 141 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 M0QYT0 321 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NDC80O14777 642 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DCLK1O15075 740 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KCNN4O15554 427 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NBNO60934 754 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GCATO75600 419 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TUSC2O75896 110 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OAZ2O95190 189 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 METTL18O95568 372 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZBED1O96006 694 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SBK3P0C264 359 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ODC1P11926 461 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CHN1P15882 459 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GOT1P17174 413 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GNALP38405 381 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NR2C2P49116 596 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PGFP49763 221 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SEC24CP53992 1094 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRMT2P55345 433 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ARL4CP56559 192 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLC8A3P57103 927 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CLRN1P58418 232 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DEUP1Q05D60 604 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SEMA3BQ13214 749 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GBX1Q14549 363 aa5.53□□□□□ -1.52
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