RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541025.2

TTR-203, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 956 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-203ENST00000541025 PRRT4C9JH25 899 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CAPN9O14815 690 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ACSL4O60488 711 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 HSF2BPO75031 334 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DAB1O75553 588 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 APODP05090 189 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MMP8P22894 467 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CCND1P24385 295 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 NBL1P41271 181 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CXCL12P48061 93 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CCR3P51677 355 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PER3P56645 1201 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 UBASH3AP57075 661 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ACAP2Q15057 778 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 GEN1Q17RS7 908 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FBXO43Q4G163 708 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 RAB6CQ53S08 254 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TMEM215Q68D42 235 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MED25Q71SY5 747 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ERICH1Q86X53 443 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ZNF677Q86XU0 584 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DRC7Q8IY82 874 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ALLCQ8N6M5 410 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 EMC1Q8N766 993 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TERB1Q8NA31 727 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DDI1Q8WTU0 396 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 C18orf8Q96DM3 657 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FAM122AQ96E09 287 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SERPINB11Q96P15 392 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ACOX2Q99424 681 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 NPY6RQ99463 290 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 NEU1Q99519 415 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DCLK3Q9C098 648 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SYNCQ9H7C4 482 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PIGVQ9NUD9 493 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DDIT4Q9NX09 232 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 COX16Q9P0S2 106 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 DEC1Q9P2X7 70 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.5□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PLXNA2O75051 1894 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CACNA1HO95180 2353 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 UNC119BA6NIH7 251 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PROB1E7EW31 1015 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 M0QYT0 321 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SGK1O00141 431 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 AP5Z1O43299 807 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SPDEFO95238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 ESRRBO95718 433 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CAVIN2O95810 425 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 LATS1O95835 1130 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 GYPCP04921 128 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 SKILP12757 684 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FERP16591 822 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 HLA-FP30511 346 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 CHKAP35790 457 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 MATKP42679 507 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 WASP42768 502 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 FOXI1Q12951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
TTR-203ENST00000541025 NME3Q13232 169 aa6.49□□□□□ -1.37
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