RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GFPT2	O94808	682 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PGLS	O95336	258 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ASMTL	O95671	621 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	F3	P13726	295 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ERCC2	P18074	760 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PTPN4	P29074	926 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	VPS16	Q9H269	839 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SP110	Q9HB58	689 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557		A6NL46	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	C21orf140	B9A014	251 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	EPHB6	O15197	1021 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	FZD6	O60353	706 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SOCS5	O75159	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN7	O94888	489 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KLK7	P49862	253 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA1	P56199	1179 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0G2JNG1	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF185	O15231	689 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	BRAF	P15056	766 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	STC1	P52823	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	RAPSN	Q13702	412 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-222	ENST00000533557	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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