RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 KNTC1P50748 2209 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 NUAK1O60285 661 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PPFIA2O75334 1257 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MTX2O75431 263 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ANXA6P08133 673 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CTSEP14091 401 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MAGEA6P43360 314 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CLDN6P56747 220 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FOXK2Q01167 660 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CTBSQ01459 385 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FOXC1Q12948 553 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 GUSBP11Q6P575 273 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 A6NCN8 305 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 H7C0S8 307 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CCL22O00626 93 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SGTAO43765 313 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PHF2O75151 1096 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 RFPL3O75679 317 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TRIM16O95361 564 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 EML2O95834 649 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ALPPL2P10696 532 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ARSDP51689 593 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ILKQ13418 452 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PERM1Q5SV97 790 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 DHRS13Q6UX07 377 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 XKR5Q6UX68 686 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 GKN2Q86XP6 184 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC89Q8N998 374 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 KYQ8NBH2 561 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF778Q96MU6 729 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 OR2M4Q96R27 311 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 KLK13Q9UKR3 277 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 C2orf81A6NN90 581 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 APRTP07741 180 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 B4GALNT1Q00973 533 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ACVR1Q04771 509 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 KCNJ11Q14654 390 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 POU6F1Q14863 301 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 LINC00523Q86TU6 105 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 NAGSQ8N159 534 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF398Q8TD17 642 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 RANBP9Q96S59 729 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SCNM1Q9BWG6 230 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 OR2AG1Q9H205 316 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 RMI1Q9H9A7 625 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 GPR34Q9UPC5 381 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PKP3Q9Y446 797 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TMEM63AO94886 807 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PRAMEF1O95521 474 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 ASMTLO95671 621 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CRTAMO95727 393 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 KRT14P02533 472 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PRSS56P0CW18 603 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 PTGIRP43119 386 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 FNTAP49354 379 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CTSCP53634 463 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CDH17Q12864 832 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 NFATC2Q13469 925 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC38Q502W7 563 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-211ENST00000519070 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms