RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RNF146Q9NTX7 359 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 OLAHQ9NV23 265 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ANO10Q9NW15 660 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SH3BP4Q9P0V3 963 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB9Q9UBS3 223 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 URADA6NGE7 173 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MMP3P08254 477 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MYZAPP0CAP1 466 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 APEHP13798 732 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 GPC3P51654 580 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PDE1AP54750 535 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1024LP59773 190 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF333Q96JL9 665 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SH3GL2Q99962 352 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 POLE3Q9NRF9 147 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SCP2P22307 547 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HPDP32754 393 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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