RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NOBOXO60393 691 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC6O75061 913 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 GAS8O95995 478 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC2A4P14672 509 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ADRA1AP35348 466 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LMAN1P49257 510 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.5
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC89Q8N998 374 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 IL26Q9NPH9 171 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 APPL1Q9UKG1 709 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 E7EVH7 732 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 USP12O75317 370 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CDK14O94921 469 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ECEL1O95672 775 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNB1P01574 187 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ISXQ2M1V0 245 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00523Q86TU6 105 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 MDM1Q8TC05 714 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 DKK4Q9UBT3 224 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 KMOO15229 486 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ACP5P13686 325 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 VCLP18206 1134 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CCL7P80098 99 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX1Q13596 522 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SPARCL1Q14515 664 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RTP5Q14D33 572 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNJLQ8IV13 435 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LSMEM2Q8N112 164 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL14Q8N4G2 192 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL5AQ9Y689 179 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SPEGQ15772 3267 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP104O60308 925 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL18O95568 372 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 HADHAP40939 763 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 GDF10P55107 478 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRNA6Q15825 494 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNG2Q16589 344 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 INSCQ1MX18 579 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 PROSER1Q86XN7 944 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF398Q8TD17 642 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RTP4Q96DX8 246 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 STRADBQ9C0K7 418 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK6Q9Y257 313 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 MYLKQ15746 1914 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 OR5K4A6NMS3 321 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX2O60749 519 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 FGGP02679 453 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH4A1P30038 563 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 FDFT1P37268 417 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR3P46089 330 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 NAGSQ8N159 534 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 AVL9Q8NBF6 648 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM74Q96NL1 305 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TLR10Q9BXR5 811 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 KLC4Q9NSK0 619 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT1A9O60656 530 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 AP2A1O95782 977 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT1A6P19224 532 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT1A1P22309 533 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT1A4P22310 534 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT1A3P35503 534 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms