RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 GAD1Q99259 594 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PIGQQ9BRB3 760 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RGCCQ9H4X1 137 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PANK4Q9NVE7 773 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 IFT52Q9Y366 437 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.24□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FAM149AA5PLN7 773 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 HS3ST1O14792 307 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGEF9O43307 516 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 AKR7A2O43488 359 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 AVILO75366 819 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CLPXO76031 633 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C1SP09871 688 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 COX7A2P14406 83 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 IL1R1P14778 569 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RPA2P15927 270 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CTPS1P17812 591 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PBX3P40426 434 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KCNJ5P48544 419 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC7A2P52569 658 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 JAM2P57087 298 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SP2Q02086 613 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CUZD1Q86UP6 607 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SERINC5Q86VE9 423 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MIB2Q96AX9 1013 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 HAVCR1Q96D42 359 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf92Q96LL3 132 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DRC3Q9H069 523 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NEK6Q9HC98 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 WNT16Q9UBV4 365 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NENFQ9UMX5 172 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NCAPD2Q15021 1401 aa7.23□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQ72 361 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DLL1O00548 723 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RASSF9O75901 435 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CCNB2O95067 398 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CYP21A2P08686 494 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM253P0C7T8 217 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GABRB1P18505 474 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ALDH3A1P30838 453 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CASRP41180 1078 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB8P50452 374 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 UCP2P55851 309 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 B4GALNT1Q00973 533 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GCNT1Q02742 428 aa7.22□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GRAPQ13588 217 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms