RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX12Q9BXU0 123 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CBX8Q9HC52 389 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC23Q9UJX2 597 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STK36Q9NRP7 1315 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNDC9O14530 226 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KLF4O43474 513 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINI2O75830 405 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO1DO94832 1006 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 VNN1O95497 513 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HRGP04196 525 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CD63P08962 238 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GNAO1P09471 354 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CKMT2P17540 419 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TALDO1P37837 337 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1A2P50993 1020 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTENP60484 403 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V0D1P61421 351 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASIC1P78348 528 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DSG1Q02413 1049 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NNTQ13423 1086 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NAB1Q13506 487 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB33AQ14088 237 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF6Q58WW2 860 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL23Q86XA0 190 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPV3Q8NET8 790 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HPS1Q92902 700 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IRF7Q92985 503 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 APOPT1Q96IL0 206 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DYDC2Q96IM9 177 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TET1Q8NFU7 2136 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087X0B3 334 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PPH5 198 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ABLIM3O94929 683 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TDP2O95551 362 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FABP1P07148 127 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C8AP07357 584 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCCHC18P0CG32 403 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TPBGLP0DKB5 382 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TGM1P22735 817 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP1P29466 404 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA9P31269 272 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RASSF2P50749 326 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 METAP1P53582 386 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TCF15Q12870 199 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMK2DQ13557 499 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HPS6Q86YV9 775 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMC8Q8IU68 726 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASB12Q8WXK4 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPZA3Q96KX2 299 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms