RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 F9P00740 461 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 THEGLP0DJG4 465 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 CKMT1AP12532 417 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF20P17024 532 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 RRM1P23921 792 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT9P35527 623 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ETV4P43268 484 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCG1P45844 678 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX16P57768 344 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT83P78385 493 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMG2Q02383 582 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC20A2Q08357 652 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 NME3Q13232 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 MIIPQ5JXC2 388 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 TRNP1Q6NT89 227 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 PCSK4Q6UW60 755 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ARCQ7LC44 396 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 ERICH1Q86X53 443 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 XYLT1Q86Y38 959 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 PASD1Q8IV76 773 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST14Q8NCH0 376 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 DLG3Q92796 817 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 FGF11Q92914 225 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 HIC2Q96JB3 615 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 HAPLN3Q96S86 360 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SIK2Q9H0K1 926 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10A5Q9H207 317 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.376e-9■■□□□ 13.2
PRPF40A-210ENST00000489741 COX16Q9P0S2 106 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 POM121BA6NF01 834 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SCAMP1O15126 338 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1G1O43747 822 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 BRINP1O60477 761 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SDC3O75056 442 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PIAS2O75928 621 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GP1BAP07359 652 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RHOCP08134 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PRLRP16471 622 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF18P17022 549 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 AKT2P31751 481 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FLT3P36888 993 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 USP8P40818 1118 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 BPIFB4P59827 614 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CD83Q01151 205 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TLE3Q04726 772 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FZD2Q14332 565 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF460Q14592 562 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ICAM4Q14773 271 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LINGO4Q6UY18 593 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZSR6 202 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MLKLQ8NB16 471 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CALML6Q8TD86 181 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB12Q8WXK4 309 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK6Q92876 244 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C18orf8Q96DM3 657 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FEM1CQ96JP0 617 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TBCBQ99426 244 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PIF1Q9H611 641 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MPP6Q9NZW5 540 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 IL36AQ9UHA7 158 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB1Q9Y576 335 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TENM4Q6N022 2769 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM131Q92545 1883 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms