RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TTC30BQ8N4P2 665 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 S100ZQ8WXG8 99 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ROPN1LQ96C74 230 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TMEM209Q96SK2 561 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 BDH2Q9BUT1 245 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CMTM6Q9NX76 183 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 NOTOA8MTQ0 251 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TARM1B6A8C7 271 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 F8W810 466 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ASNA1O43681 348 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 INMTO95050 263 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CDH13P55290 713 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R39P59534 338 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 COPZ1P61923 177 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CAMK2BQ13554 666 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 POU6F1Q14863 301 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MEP1AQ16819 746 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TMEM236Q5W0B7 351 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HOMEZQ8IX15 550 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CHID1Q9BWS9 393 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SIK2Q9H0K1 926 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CASS4Q9NQ75 786 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 BNIP2Q12982 314 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TAC4Q86UU9 113 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HEATR4Q86WZ0 1026 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 WDCPQ9H6R7 721 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SYCE1LA8MT33 242 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GUCY1B2O75343 617 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B4P06133 528 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GPIP06744 558 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 DGCR6Q14129 220 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MORN1Q5T089 497 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SCML4Q8N228 414 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HDAC11Q96DB2 347 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RNF38Q9H0F5 515 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RMND5AQ9H871 391 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HPS4Q9NQG7 708 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HACD3Q9P035 362 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GLTPD2A6NH11 291 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 BMP4P12644 408 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A2P23975 617 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CRHBPP24387 322 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 BRCC3P46736 316 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 VBP1P61758 197 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAP2K5Q13163 448 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 NFYCQ13952 458 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RAB41Q5JT25 222 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SPRYD7Q5W111 196 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PAGE2Q7Z2X7 111 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D21Q8IYX1 336 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MYLPFQ96A32 169 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 C3orf30Q96M34 536 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FAM105AQ9NUU6 356 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 EXD2Q9NVH0 621 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAGEB16A2A368 324 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ARL5CA6NH57 179 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 H3BMM5 538 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 DFFAO00273 331 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 C7P10643 843 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CAPN3P20807 821 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 APLP1P51693 650 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SCAPQ12770 1279 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 LCN8Q6JVE9 175 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms