RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC28A2	O43868	658 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PYGL	P06737	847 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	MX2	P20592	715 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	CD82	P27701	267 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	MAN1A1	P33908	653 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	UGT1A3	P35503	534 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	MAPK9	P45984	424 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	DYNLT1	P63172	113 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	HHEX	Q03014	270 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	AP1B1	Q10567	949 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	LRP8	Q14114	963 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	VPS18	Q9P253	973 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM204A-208	ENST00000487269	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	AURKA	O14965	403 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	NUAK1	O60285	661 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	MTX2	O75431	263 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT1	P04264	644 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TNNT1	P13805	278 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	LIF	P15018	202 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	CA4	P22748	312 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	GPLD1	P80108	840 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	DSG2	Q14126	1118 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	PCSK7	Q16549	785 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	NCSTN	Q92542	709 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.77	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53	3e-7	■■■■■ 34.8
FAM204A-208	ENST00000487269	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269		B4E171	279 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	APOL1	O14791	398 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ZW10	O43264	779 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	GRID2	O43424	1007 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	DUX1	O43812	170 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	AKR1B10	O60218	316 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	RAD1	O60671	282 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	ITGB2	P05107	769 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	F3	P13726	295 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	BPI	P17213	487 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	CA5A	P35218	305 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPAN7	P41732	249 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	GFER	P55789	205 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	PEX6	Q13608	980 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM204A-208	ENST00000487269	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.76	□□□□□ -0.53

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