RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ITPKAP23677 461 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARNTP27540 789 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXN2P32314 431 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 STX2P32856 288 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 TTPAP49638 278 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 THOP1P52888 689 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PFN3P60673 137 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDK3Q00526 305 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTK2BQ14289 1009 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ITIH4Q14624 930 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CES3Q6UWW8 571 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNMB4Q86W47 210 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NXPE1Q8N323 547 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPR150Q8NGU9 434 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDKL2Q92772 493 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CERS2Q96G23 380 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf72Q96LT7 481 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC6A18Q96N87 628 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCF12Q99081 682 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 MYOCQ99972 504 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 APOOQ9BUR5 198 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPR27Q9NS67 375 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 VPS18Q9P253 973 aa11.35□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PR77 199 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 POM121BA6NF01 834 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CFAP99D6REC4 459 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 F8W8V4 182 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCL22O00626 93 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 VILLO15195 856 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ERLIN1O75477 346 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ABHD2P08910 425 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 THEGLP0DJG4 465 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACRV1P26436 265 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAOBP27338 520 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PMLP29590 882 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 MPLP40238 635 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PMS2P54278 862 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 C21orf59P57076 290 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLDN2P57739 230 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NAB1Q13506 487 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NFATC4Q14934 902 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NEPROQ6NW34 567 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 MACC1Q6ZN28 852 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZSR6 202 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 GALNT7Q86SF2 657 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 CNPY4Q8N129 248 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 GDAP1Q8TB36 358 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PIGKQ92643 395 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX14Q96I36 57 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 BMFQ96LC9 184 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 AGAP2Q99490 1192 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 COPS8Q99627 209 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.34□□□□□ -0.59
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC151A5D8V7 595 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 H0Y8X5 98 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 TLR4O00206 839 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 QSOX1O00391 747 aa11.33□□□□□ -0.6
ARHGEF3-211ENST00000486829 TNFRSF10CO14798 259 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms