RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CLDN20P56880 219 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TAS2R38P59533 333 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PRAMEP78395 509 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PPP2R2BQ00005 443 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RUNX1T1Q06455 604 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC20A2Q08357 652 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SREBF2Q12772 1141 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 STK4Q13043 487 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADIPOQQ15848 244 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LCN10Q6JVE6 187 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RGMBQ6NW40 437 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CUZD1Q86UP6 607 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SATL1Q86VE3 508 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PGAM5Q96HS1 289 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C3orf30Q96M34 536 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FIZ1Q96SL8 496 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CSTL1Q9H114 145 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GAREM1Q9H706 876 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 B4DLN1 442 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 WISP2O76076 250 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R3DO95685 299 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 STARD3NLO95772 234 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GLUD1P00367 558 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LINC00271P0C7V0 271 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ITGA2P17301 1181 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HOXC9P31274 260 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PRCPP42785 496 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GLUD2P49448 558 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GPR143P51810 404 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ISL1P61371 349 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LTBQ06643 244 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 EPS8Q12929 822 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCTD2Q14681 263 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ASIC2Q16515 512 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CTF1Q16619 201 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MYLK3Q32MK0 819 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 BRINP3Q76B58 766 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CEP97Q8IW35 865 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 POC5Q8NA72 575 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SGCDQ92629 289 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PHF21BQ96EK2 531 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HRH4Q9H3N8 390 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 STK39Q9UEW8 545 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PP11 408 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD28O15084 1053 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SPINT2O43291 252 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 FIBPO43427 364 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HLA-DOBP13765 273 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MYOD1P15172 320 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms