RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 TFR2Q9UP52 801 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 CHKBQ9Y259 395 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 A0A087X0T9 212 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 EFCAB7A8K855 629 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 SUV39H1O43463 412 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 CLDN7O95471 211 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ASMTLO95671 621 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM228BP0C875 321 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 LIFP15018 202 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF30P17039 623 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 FASLGP48023 281 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 CSRP3P50461 194 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATP1A2P50993 1020 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 EPHB1P54762 984 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 GPLD1P80108 840 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 PEX6Q13608 980 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 LRP8Q14114 963 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 DPYSL3Q14195 570 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKS6Q68DC2 871 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 NLRP8Q86W28 1048 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM129CQ86XR2 697 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 EXD1Q8NHP7 514 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAML1Q92585 1016 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 DDA1Q9BW61 102 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZMYND15Q9H091 742 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 IL17BQ9UHF5 180 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2Q1-205ENST00000483639 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 B4E171 279 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 MATN3O15232 486 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 DNAJC6O75061 913 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 SERPING1P05155 500 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 HLA-DQB2P05538 268 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTAGE8P0CG41 777 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 TSPAN7P41732 249 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAGEA1P43355 309 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 GBE1Q04446 702 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 NFATC2Q13469 925 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATG14Q6ZNE5 492 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PQLC3Q8N755 202 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 BMPERQ8N8U9 685 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 OR10G6Q8NH81 332 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC38A3Q99624 504 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTRCQ99895 268 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PDP2Q9P2J9 529 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 KCNK6Q9Y257 313 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 A6NCN8 305 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 RCCD1A6NED2 376 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 A8MU76 341 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 MYO1FO00160 1098 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 DUX1O43812 170 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 RAD1O60671 282 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PPFIA2O75334 1257 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PYGLP06737 847 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 SFTPCP11686 197 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 ACP5P13686 325 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCNCP24863 283 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 TAS2R40P59535 323 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2Q1-205ENST00000483639 CBX1P83916 185 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms